작년에 회사를 퇴사한 경우 연말정산 신고 대신 종합소득세 신고?

작년에 퇴사해서 회사 연말정산(회사에서 1~2월에 하는 정산)을 못 했거나, 이직/퇴사로 인해 공제자료를 제대로 못 넣었다면, 보통은 **다음 해 5월 종합소득세(근로소득자 신고)로 “내가 직접 연말정산을 마무리”**하는 흐름이 됩니다.

그럼 (현재 2025-12-12 기준, 2025년 귀속 → 2026년 5월 신고)으로 한 번에 정리해드릴게요.

1) 종합소득세 신고기간(종소세 신고기간)과 납부 기한

• 정기 신고기간: 통상 5월 1일 ~ 5월 31일 (해당 연도 귀속분을 다음 해 5월에 신고)
• 신고를 하면 결과가 환급(돌려받음) 또는 추가 납부로 나옵니다.

예: 2025년 귀속 소득(2025년에 벌었던 것) → 2026년 5월 1일~5월 31일에 신고하는 게 일반적입니다.

 

2) “작년에 퇴사한 직장인”은 언제 종소세를 해야 하나요?

다음 케이스 중 하나면 **5월 종소세(근로소득자 신고)**를 하는 쪽으로 생각하면 거의 맞습니다.

✅ 종소세 신고가 필요한 대표 케이스

• 중도퇴사 후 무직이라 회사가 연말정산을 안 해줬다
• 이직했는데 전/현 직장 자료가 합쳐져 정산이 안 됐다(원천징수영수증 2개 이상)
• 연말정산 때 **공제 누락(의료비/기부금/월세/교육비 등)**이 있었다
• 근로소득 외에 **부업(프리랜서·배달·유튜브·기타소득 등)**이 섞여 있다 → 근로소득만으로 끝나지 않을 수 있음

반대로, 퇴사 시점에 회사가 “중도정산(퇴사자 연말정산)”을 제대로 해줬고 + 그 해 다른 소득이 전혀 없다면, 별도 신고가 불필요한 경우도 있습니다(다만 공제 누락이 있으면 경정청구로 환급 가능).

3) 퇴사자가 5월에 “연말정산 대신” 종소세 신고하는 방법(홈택스 기준)

국세청 안내에서도 종합소득세 신고는 홈택스에서 전자신고로 진행하도록 안내합니다. 홈택스

준비물 체크리스트(퇴사자 핵심)

• (필수급) 근로소득 원천징수영수증
  • 전 직장/현 직장 각각 있으면 모두
• 연말정산 간소화 자료(의료비/보험/기부/교육/신용카드 등)
• (해당 시) 월세 계약서 + 이체내역, 안경/교복/학원비 등 간소화 누락 영수증
• (해당 시) 부업 소득 자료(지급명세서, 플랫폼 정산/입금내역 등)

신고 흐름(개념적으로)

1. 소득 불러오기(근로소득/기타소득/사업소득 등)
2. 공제 입력(간소화 + 누락분 수기 반영)
3. 결정세액 확인 → 환급/추가납부 확인
4. 지방소득세까지 마무리(종소세 신고 후 연계로 넘어가는 경우가 많음)

4) 납부는 어떻게? 환급은 언제 들어오나요?

추가 납부가 나오면

• 신고 후 바로 납부 가능(계좌이체/카드 등 선택)
• 기한 내 납부가 중요(미납이면 “납부지연” 부담이 붙을 수 있음)

환급이 나오면

• 종소세 환급은 보통 신고 마감(5/31) 이후 일정 기간 심사 후 입금됩니다.
• 안내/사례 기준으로 “5/31 종료일 기준 약 30일 전후”로 안내되는 자료들이 많습니다(개인별 심사 상황에 따라 더 걸릴 수 있음). 
• 홈택스/손택스에서 환급금 진행상태를 확인할 수 있습니다.

5) “잘못 신고했다면?” 수정신고 vs 경정청구 vs 기한후신고

여기서부터가 진짜 중요합니다. 무슨 실수냐에 따라 버튼이 달라져요.

① 세금을 “적게” 신고했다(소득 누락/공제 과다 등) → 수정신고

• 나중에 발견되면 수정신고로 바로잡는 쪽
• 추가 세액 + 경우에 따라 가산세 이슈가 생길 수 있어 “빨리 정정”이 유리

② 세금을 “더 많이” 냈다(공제 누락 등) → 경정청구(환급받기)

• 대표적으로: 의료비/기부금/월세/교육비 등 공제 누락
• 원칙적으로 법정신고기한이 지난 뒤 5년 이내 청구 가능(대표 규정으로 널리 운영)
• “연말정산 때 놓친 거”를 뒤늦게 챙겨 환급받는 경우가 여기에 많이 해당됩니다.

③ 신고 자체를 못 했다 → 기한후신고

• 신고를 아예 안 했다면 기한후신고로 제출 가능
• 다만 무신고 가산세 등 불이익 가능성이 있어, 가능한 빨리 정리하는 게 좋아요.

6) 퇴사자들이 특히 자주 틀리는 포인트 TOP 5

1. 전 직장 원천징수영수증 누락(이직/퇴사자 최다 실수)
2. 연말정산 간소화에 안 뜨는 항목(월세, 안경, 일부 학원비/기부금 등) 누락
3. “나는 월급만”이라 생각했는데 기타소득/부업 소득이 이미 잡혀있는 경우
4. 부양가족 공제 중복(부부가 같은 자녀를 각각 넣는 등)
5. 종소세 신고만 하고 지방소득세 마무리를 놓침(연계 화면 끝까지 확인 필요)